궁내부(宮內府) 소속으로 황후에 관련된 일을 맡은 황후궁(皇后宮), 황태자의 교육을 담당한 시강원(侍講院), 황제의 손자를 교육하는 강서원(講書院), 황태자비에 관한 일을 맡은 황태자비궁(皇太子妃宮), 황자(皇子)의 보익(輔翼), 시강, 호종(護從)을 담당한 친왕부(親王府), 황가의 사무와 회계를 맡아보던 황족가(皇族家), 황족의 자제를 가르치는 종인학교(宗人學校), 황실 경비의 예산·결산을 맡은 내장원(內藏院), 황제의 진찰과 어약(御藥)의 조화(調和)를 맡아보던 태의원(太醫院), 시종(侍從)과 시강(侍講)을 관장하는 시종원(侍從院), 황명의 출납과 기록을 맡아본 비서원(秘書院), 황실의 예산, 지출을 맡아보던 회계원(會計員), 황실의 계보를 맡은 종정원(宗正院), 황제의 친척·외척 보첩(譜牒)을 관장한 돈녕원(敦寧院)이 있었다.
환구단의 일을 맡아보던 환구단사제서, 종묘를 관리하는 종묘서(宗廟署), 사직단(社稷壇)을 관리하는 사직서(社稷署), 태조·세조·원종·숙종·영조·순조의 어진을 모신 영희전(永禧殿), 어진(御眞)·어제(御製) 어필(御筆)과 왕실의 전적, 도서의 모각(模刻) 등사(等事)를 관장하던 규장각(奎章閣), 경서(經書)·사적(史籍)의 관리, 문한(文翰) 처리, 황제를 자문하는 홍문관(弘文館), 의식과 제례(祭禮), 외국 사절의 인접(引接)을 관장하던 장례원(掌禮院), 황실 제도를 맡아보던 제실제도정리국(帝室制度整理局), 황제의 의복, 보물을 관리하는 상의사(尙衣司), 제사(祭祀)와 시호(諡號)를 맡은 봉상시(奉常寺), 창덕궁 후원을 관리하는 비원(秘院), 궁중의 연회·음식을 맡은 전선사(典膳司), 황제의 호위를 맡은 호위대(扈衛隊)가 있었다.
국내외 서적을 보관하는 박문원(博文院), 궁궐을 경비하는 경위원(警衛院), 외국과의 왕복 서류 번역을 맡은 예식원(禮式院), 도량형을 관장하는 평식원(平式院), 외국여행을 관장한 수민원(綬民院), 관개(灌漑)·관수(灌水)를 맡은 수륜원(水輪院), 개간(開墾)종식(種植)천택(川澤)강해(江海)제언(堤堰)어렵(漁獵)과 진상을 담당한 어공원(御供院), 황실의 토목, 건축, 영선을 맡은 영선사(營繕司), 황제가 타는 말과 수레를 관리하는 태복사(太僕司), 전화와 철도를 맡은 통신사(通信司), 광산을 맡은 광학국(鑛學局), 전각의 수리를 맡은 주전사(主殿司), 궁중 물품 구입, 건축물을 수리하는 물품사(物品司), 식료품 및 특산물을 담당한 제용사(濟用司), 사찰과 산림, 성보(城堡)를 담당한 관리서(管理署), 철도를 관장하는 철도원(鐵道院)이 있었다.